Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCHS1Q96JQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms