Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRIQ1Q96JM4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
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