Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED3Q96IU2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED3Q96IU2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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