Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MS4A3Q96HJ5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms