Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCMH1Q96GD3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms