Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC51Q96ER9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms