Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAF2Q96CS3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms