Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM3DQ96BQ1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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