Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR2Q969E8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms