Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-CQ95604 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms