Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF3AQ92664 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms