Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF3Q92576 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms