Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RGP1Q92546 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms