Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PALLDQ8WX93 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PALLDQ8WX93 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms