Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZIC4Q8N9L1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms