Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROM2Q8N271 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms