Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNE4Q8N205 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNE4Q8N205 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms