Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLF2Q8IX21 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms