Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLNKQ7Z7G1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms