Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYDE1Q6ZW31 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms