Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD6Q6ZV73 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms