Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms