Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SDE2Q6IQ49 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms