Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF123Q5XPI4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms