Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RIF1Q5UIP0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms