Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C10orf55Q5SWW7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms