Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KCNT1Q5JUK3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KCNT1Q5JUK3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms