Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPHKAPQ2M3C7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPHKAPQ2M3C7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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