Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC27Q2M243 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms