Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MICAQ29983 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MICAQ29983 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MICAQ29983 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms