Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FXNQ16595 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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