Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SNAPC1Q16533 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNAPC1Q16533 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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