Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8Q15843 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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