Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC85BQ15834 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms