Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF1AQ15573 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF1AQ15573 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms