Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PCM1Q15154 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PCM1Q15154 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PCM1Q15154 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PCM1Q15154 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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PCM1Q15154 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PCM1Q15154 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCM1Q15154 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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PCM1Q15154 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCM1Q15154 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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