Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
EEA1Q15075 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EEA1Q15075 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms