Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FRMPD4Q14CM0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms