Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIN2CQ14957 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIN2CQ14957 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms