Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD4Q14839 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHD4Q14839 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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