Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA3AQ14563 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms