Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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HNF4GQ14541 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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HNF4GQ14541 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF4GQ14541 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF4GQ14541 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF4GQ14541 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF4GQ14541 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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