Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FAM53BQ14153 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FAM53BQ14153 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FAM53BQ14153 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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FAM53BQ14153 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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FAM53BQ14153 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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