Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK13Q14004 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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