Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PDE6HQ13956 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms