Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
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SHROOM2Q13796 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SHROOM2Q13796 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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SHROOM2Q13796 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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SHROOM2Q13796 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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SHROOM2Q13796 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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SHROOM2Q13796 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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SHROOM2Q13796 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
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SHROOM2Q13796 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SHROOM2Q13796 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
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