Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PMS2P11Q13670 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms