Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL1Q13616 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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