Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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