Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
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